Archiwum miesiąca: grudzień 2011

R rozszerzenia i R paczki

Dodaj komentarz

Osoby zainteresowane opublikowaniem swego kodu utworzonego w R project, zarówno w czystym R jak i w postaci rozszerzeń w innych językach, na pewno zainteresują materiały na stronie http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html. Materiały tam zebrane omawiają szczegółowo i wyczerpująco temat tworzenia własnych dodatków do R. Osobom które początkują w tym temacie polecam nieco bardziej „lżejsze” lektóry w postaci:

– opracowania krok po kroku jak tworzyć paczki w R http://cran.r-project.org/doc/contrib/Leisch-CreatingPackages.pdf

– w googlu albo http://search.carrot2.org/stable/search wstukać frazę Writing R Extensions 

Osobiście korzystałem z pierwszego jak i drugiego linku. Natomiast projekt który utworzyłem związany z implementacją softu do kalsyfikacji umieściłem na platformie http://r-forge.r-project.org/.

Resolved problem with revoIPC 1.0-3 and new g++

2 komentarze

Few days ago I had a installation problem package revoIPC 1.0-3 and doSMP 1.0.1. When I was compiled revoIPC 1.0-3, compilator returned this error:

g++ -I/usr/local/lib64/R/include  -I/usr/local/include   -I . -fpic
-g -O2 -c interface.cc -o interface.o
In file included from ./boost/interprocess/detail/

utilities.hpp:29:0,
                from ./boost/interprocess/mapped_region.hpp:20,
                from
./boost/interprocess/detail/managed_open_or_create_impl.hpp:17,
                from boost/interprocess/managed_mapped_file.hpp:20,
                from queue.h:17,
                from interface.cc:3:
./boost/interprocess/detail/iterators.hpp:352:15: error: reference
'm_value’ cannot be declared 'mutable’ [-fpermissive]
make: *** [interface.o] Błąd 1
ERROR: compilation failed for package 'revoIPC’

Rich Calaway from revolutionanalytics.com helped me quickly and sent solution. The patch with fix this problem is a:

„… go to src/boost/interprocess/detail/iterators.hpp and comment out lines 341-353”

Thanks for this advice we can compile revoIPC 1.0-3 and use it in with doSMP 1.0.1. Just one thinks, if we use doSMP 1.0.1 in new revoIPC 1.0-4 and we try execute this program:

rmSessions(all.names = TRUE)
w <- startWorkers(2)
registerDoSMP(w)
foreach(i=1:3) %dopar% sqrt(i)

R return this error:

> foreach(i=1:3) %dopar% sqrt(i)  *** caught segfault ***
address 0x7fd0e562f58c, cause 'memory not mapped’ Traceback:
 1: .Call(„returnResult”, q, t$task, serialize(res, NULL))
 2: ipcTaskReturnResult(taskq, taskchunk, resultchunk)
 3: doSMP:::workerLoop(qname, rank, verbose, out)
aborting …

Rich Calaway helped me fixed this problem to. I don’t check it but if someone want to use revoIPC 1.0-4 must:

„… remove the PKG_CPPFLAGS=-DNDEBUG line from Makevars.in in the src directory.”

Good luck.

Artykuły

Dodaj komentarz

Na koniec roku spłynęły recenzje artykułów oddanych do czasopism. Trochę się tego nazbierało a sam rok był bardzo owocny w badania i eksperymenty, przynoszące dość zaskakujące rezultaty.

Zainteresowane osoby tematyką eksploracji danych a dokładniej eksploracją danych tekstowych miło mi jest poinformować, że na ten temat będą mogły poczytać w czasopiśmie Metod Informatyki Stosowanej (http://www.pan.wi.zut.edu.pl/). Artykuł opisujący dziedzinę eksploracji danych tekstowych wraz z jej zastosowaniem w Państwowej Straży Pożarnej PSP nosi tytuł Proces i metody eksploracji danych tekstowych do przetwarzania raportów z akcji ratowniczo-gaśniczych i ukarze się w numerze 4/2011 ww. czasopisma. Z tematyką tą związany jest też następny artykuł pt. System informacyjny na temat sieci hydrantów dla krajowego systemu ratowniczo-gaśniczego: metoda segmentacji tekstu i jej ocena, który także zostanie wydany w tym czasopiśmie i ukaże się w numerze 1/2012. W artykule tym opisano szczegółową realizację eksperymentu opisującą podział tekstu na segmenty. Zajawka tego jak i poprzedniego artykułu w postaci abstraktów dostępne są w dziale Abstrakty, życzę miłej lektury.

Ostatnim nadesłanym do ww. czasopisma artykuł stanowił opis projektu związanego z rozwijaną koncepcją Systemu Wspomagania Decyzji dla PSP z wykorzystaniem komponentów platformy do planowania zasobów przedsiębiorstwa ERP. Artykuł ten ukaże się pod tytułem Wykorzystanie komponentów platformy ERP do budowy drugiej generacji hybrydowego systemu wspomagania decyzji dla PSP, w numerze 3/2011. Również jego zajawkę można zobaczyć w dziale Abstrakty.

Aktualnie cały czas oczekuje na decyzje z wydawnictwa CNBOP „Bezpieczeństwo i Technika Pożarnicza” w którym umieściłem dość interesujące przemyślenia i badania z zakresu inżynierii oprogramowania jak i eksploracji i segmentacji raportów. Niestety na ich ukazanie jak i recenzje jeszcze widać trochę będzie trzeba poczekać.